RefSeq NC_002932.3
Accession number NC_002932.3
DoriC accession number ORI10010021
OriC length 271 nt
OriC AT content 0.616236
The location of oriC region 1127..1397 nt
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OriC map
OriC sequences
dnaNCTTCTTACAATCTTTATTTTTATATAAAAGATTTGTTGTTGTTGTTGAGCTTGTGGAAATCTGGACAGGGGAGCAATGAGACTCATTAAAATGTTATTTTATAATACGTTGTGTTCTTAATTTCTCTTCCATCTTCTGTGGATAGTGTGTTTATTTCCCTCCACAGGGCAGTTGACGGTTTGTTGGTGATTTCATGCGGCAACCCCACAGTGTTGATAACTCCCCTGAAATCAAGATTGCGCCAACAGGTTTTGAACAGGTTATACACAGGdnaA
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif VACAGG

StartP-valueSite
2668.32e-05ACAGGTTATACACAGG
1628.32e-05TATTTCCCTCCACAGGGCAGTTGACG
2552.01e-04ACAGGTTTTGAACAGGTTATACACAG
2442.01e-04AGATTGCGCCAACAGGTTTTGAACAG
643.01e-04TGGAAATCTGGACAGGGGAGCAATGA

Motif AACYCCMC

StartP-valueSite
2014.23e-06TTCATGCGGCAACCCCACAGTGTTGATA
2187.90e-06CAGTGTTGATAACTCCCCTGAAATCAAG

Motif TGCGSC

StartP-valueSite
2388.76e-05AAATCAAGATTGCGCCAACAGGTTTT
1951.93e-04GGTGATTTCATGCGGCAACCCCACAG
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI10010021 100.0 271 0 0 1 271 1 271 0.0 501