RefSeq NC_002771.1
Accession number NC_002771.1
DoriC accession number ORI10010020
OriC length 221 nt
OriC AT content 0.832579
The location of oriC region 1..221 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif GTKGATAAR

StartP-valueSite
1441.67e-06AGTATTTTTTGTGGATAAATCTATCTGAA
1023.40e-06TATATTTTTTGTTGATAAGTACTTAAAAG

Motif SCWMAAKWAAACYAWG

StartP-valueSite
1201.08e-09GTACTTAAAAGCTCAATAAAACCAAGTATTTTTTGT
635.99e-09AAAAACTTATCCAAAAGTAAACTATGTTAATAATTT

Motif CTSAAT

StartP-valueSite
1582.07e-04ATAAATCTATCTGAATTTCACTAATT
435.04e-04TTGTTATTTTCTCAATTTTAAAAAAC
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI10010020 100.0 221 0 0 1 221 1 221 0.0 409